หมู่อาร์เอ็นเอไฮดรอกซิมีหมู่ไฮดรอกซิลอยู่ที่ตำแหน่ง 2" ของน้ำตาลไรโบส สิ่งนี้ทำให้ RNA แตกต่างจาก DNA และทำให้ RNA ใช้รูปทรงเรขาคณิตรูปแบบ A แทนที่จะเป็นรูปแบบ B ที่สังเกตได้บ่อยที่สุดใน DNA ซึ่งหมายความว่ามีร่องหลักที่ลึกและแคบมาก และร่องรองที่ตื้นและกว้างเรื่องที่เกี่ยวข้องการวิเคราะห์ทรานสคริปโตมิกส์ระบุโมเลกุล RNA แบบวงกลมคล้ายไวรอยด์หลายพันโมเลกุลวัคซีน RNA ที่ขยายตัวได้เองแบบใหม่มอบการป้องกันที่ทนทานต่อ COVID-19 ลดการแพร่ของไวรัสในการศึกษาไพรเมตระดับ RNA ของ SARS-CoV-2, IFN-1, ISGs และการตอบสนองของยีน NF-κB ภายในทางเดินหายใจของผู้ป่วย COVID-19 ที่ไม่รุนแรงและรุนแรงหมู่ไฮดรอกซิลที่ 2" หมายความว่าในบริเวณที่ยืดหยุ่นของสารเคมีในโมเลกุล RNA อาจโจมตีพันธะฟอสโฟไดเอสเทอร์ที่อยู่ติดกันเพื่อแยกกระดูกสันหลังออกกลุ่มอาร์เอ็นเอฟอสเฟตกลุ่มฟอสเฟตติดอยู่กับตำแหน่ง 3" อาร์เอ็นเอ  ของไรโบสหนึ่งตัวและตำแหน่ง 5" ของไรโบสถัดไปหมู่ฟอสเฟตมีประจุเป็นลบ สิ่งนี้ทำให้ RNA เป็นโมเลกุลที่มีประจุ (polyanion)ครงสร้างตติยภูมิของ RNAเมื่อ RNA ถูกสร้างขึ้น เช่นเดียวกับโปรตีน มันจำเป็นต้องผ่านการเปลี่ยนแปลงเพื่อสร้างโครงสร้างระดับตติยภูมิที่เฉพาะเจาะจง โครงสำหรับโครงสร้างนี้จัดทำโดยองค์ประกอบโครงสร้างทุติยภูมิซึ่งเป็นพันธะไฮโดรเจนภายในโมเลกุล เส้นใยสร้างห่วงกิ๊บนูนและห่วงภายใน เนื่องจากมีประจุ RNA ไอออนของโลหะ เช่น Mg2+ จึงมีความจำเป็นในการทำให้โครงสร้างทุติยภูมิและตติยภูมิจำนวนมากมีเสถียรภาพโครงสร้างตติยภูมิของ RNA ถูกกำหนดโดยใช้การตรวจสอบทางเคมีและการทำแผนที่การรบกวนการ